我的应用检测到FIFO满中断或者超时中断后，读出FIFO长度后，确认应用的缓冲区不够接收所有的CH9434的数据，我想要分成多次读取，请问可以吗？如果可以的话，FIFO计数器  是会自动更新的吗？

可以多次读，但是我们建议触发什么中断就一次读取对应的长度，看您的问题，可能是您设置的接受FIFO触发值设置过大，我们最小是可以设置到256字节的，一般定义的缓冲区应该不会这么小，256字节应该可以满足你一次读取的要求。